Командир - сволочь.
Это ещё не проституция, но уже рядом.

Morpeh-pulemyotchik
Быть голым - всё же ещё не самое страшное.
Хуже - то, что в любой момент тебя могут препарировать живьём без наркоза. Или посадить в камеру и пустить какой-нибудь газ. Или испытать на тебе новенькую лазерную винтовку.
И главное проклятие ведьм - зависимость от таблеток. Ты можешь сбежать из лаборатории - но ты никогда не убежишь от этой зависимости, никогда не соскочишь с колёс. И без них умрёшь, медленно и мучительно.
Также не исключено, что некоторые ведьмы могли подвергаться в лаборатории сексуальному насилию.

Думаю, при необходимости их раздевали - чтобы одежда не мешала исследователям. Одевали их вроде тогда, когда отправляли "на дело". А в начальных сериях двух "ведьм" везли куда-то голыми и связанными.

У рогатых нет двух таких явных уязвимостей, которые есть у ведьм.
Первая уязвимость - ведьма сдохнет, если нажать кнопку извлечения железяки с паразитом. А это способен сделать любой дурак, окажись он сзади.
Вторая, ещё похлеще - зависимость от таблеток. Без них ведьма просто помрёт.
Со стороны кажется, что на ведьмах меньше ограничений и они в более человеческих условиях, но если призадуматься, эта зависимость от таблеток - худшие путы. Это очень похоже на зависимость наркомана, который за дозу готов и предоставить в пользование своё тело, и убить человека. Только наркоман ещё может "переломаться" и соскочить, а ведьма умрёт - поэтому это хуже даже героина. А люди в лаборатории, которые превращали обычных девочек в ведьм, в этом плане похожи на типичных наркодиллеров, которые заслуживают только виселицу.
Сбежавшая из лаборатории рогатая не нуждается в таблетках, и оторвавшись и скрывшись подальше может просто спокойно бомжевать.

А вообще - хреново и тем и другим. И над теми, и над другими ставят опыты, которые могут закончиться смертью (могут испытать химическое или биологическое оружие, огнестрел, вскрыть живьём, посадить голыми в морозилку, да что угодно). И те, и другие, сбежав из лаборатории, оказываются в положении беглого заключённого в федеральном розыске, в чём мало приятного.

Это всё равно, что спрашивать, кому в мире "Волшебницы Мадоки" более хреново живётся - тамошним волшебницам или тамошним ведьмам? И тем, и другим в равной мере несладко, и те и другие убивают друг друга, и в итоге

Хорошо только Вальпургиевой Ночи, потому что она размером со здание, бессмертна и неуязвима.

Кого-то может и выращивали. Например, девочку с острыми зубами, которая стреляла изо рта лазером. Их происхождение не показали, но многие могли быть синтетическими, созданными как раз в колбе с помощью биотехнологий. А Куронэко, по сути, превратили в абсолютно разумного зомби-мутанта. Учитывая, с какой высоты она упала, я могу предположить, что некоторое время она реально было мертва. Сотрудники лаборатории оживили труп, заставив его регенерировать все повреждения. Resident Evil, однако.

Не думаю. Их держали голыми (не одевали) с рождения, поэтому, скорее всего, их это волновало в последнюю очередь. Для них быть голыми - естественно, как для животных. А людьми их и не считали.

Ей, скорее всего, не хватило для этого интеллекта.

Такие лимиты не были проверены.

Мне интересно другое - как у главного героя (Рёты Мураками) поселилась в голове Нанами.
Как она сказала, она стёрла себя из памяти девочек, но записалась в его памяти.
Но если бы он просто её помнил - она была бы просто образом в его памяти, как и в случае с памятью любого человека. Но никак бы не визуализировалась и не являлась бы ему как какая-то тульпа.
Тут, похоже, нечто другое.
Всё сознание Нанами, весь её разум были записаны на сверхчеловеческий, ничего не забывающий мозг Рёты Муаками. Записано как софт, как компьютерная программа.
И его мозг теперь содержит целое живое и разумное сознание Нанами. И все Её воспоминания. Включая все воспоминания, скопированные Нанами из мозгов других ьюдей.
А учитывая, что Рёта ничего не забывает...
У него теперь одновременно и обширная база данных в голове, в том числе и про все эти исследования, и второй интеллект в дополнение к своему.